Лечение туберкулеза кишечника осуществляют в специализированных туберкулезных стационарах специфическими противотуберкулезными препаратами. В период обострения пищу следует давать в протертом виде, дробно (4-5 раз в день), она должна быть богатой белками, легко усвояемыми жирами и витаминами. При нарушении ферментативных процессов в кишечнике дополнительно назначают препараты пищеварительных ферментов, при железодефицитной анемии — парентерально вводят препараты железа.

Прогноз. Течение туберкулеза кишечника при отсутствии соответствующего лечения обычно прогрессирующее. Прогноз в значительной степени определяется тяжестью туберкулезного поражения кишечника, а также легких и других органов. Возможные осложнения — сужения просвета кишки, кишечная непроходимость, перитонит, перфорация туберкулезных язв, кишечное кровотечение, синдром недостаточности всасывания, амилоидоз — ухудшают прогноз.