Диагностика коклюша на катаральной стадии возможна лишь после проведения бактериологических лабораторных исследований. Как правило, они назначаются на основании эпидемиологических сведений, например если зафиксирован контакт человека с больным коклюшем, нет вакцинации и т. п. Если уже началась стадия судорожного кашля, диагностировать коклюш намного проще, потому что начинаются характерные для заболевания симптомы.