Реконструкция распространения смертельных заболеваний, таких как туберкулез от человека к человеку с использованием анализа последовательности генов ДНК позволяет быстро определить происхождение и распространение возбудителей заболевания. «Этот подход позволяет непосредственно информировать организации здравоохранения о стратегии борьбы со вспышками инфекционных заболеваний», — сообщил ученый, выступая на осенней конференции по общей микробиологии в университете графства Уорик.
Группа ученых из центра борьбы с заболеваниями, находящегося в Британской Колумбии, Ванкувер, Канада провели полный анализ генома с целью анализа ДНК бактерий в пробах, взятых у 36 из 41 инфицированного лица при вспышке ТБ. Они смогли проследить пути распространения возбудителя среди всего населения Британской Колумбии вплоть до того места, откуда началось распространение вспышки и в каком порядке заражение передавалось от человека к человеку. Исходя из этого, они смогли определить основных лиц, места и поведение людей, которое способствовало распространению болезни. Они продемонстрировали, каким образом социальная структура населения способствовала быстрому распространению туберкулеза и как рост употребления кокаина крэка в данном регионе, вероятно, вызвал вспышку.
Более ранние эпидемиологические средства анализировали некоторые, но не все ДНК в зараженных образцах. Это давало слишком мало информации для точной реконструкции вспышки и ученые могли только высказывать обоснованные догадки о том, каким образом возбудитель распространился среди населения. Ведущий исследователь доктор Дженнифер Гарди, выступая на конференции, сказал: „Решение задачи поиска причин вспышки, т.е. выявление источника заболевания и основных путей передачи инфекции является пресловутой чашей Грааля в эпидемиологии. Используя полный анализ генома, мы теперь можем действовать подобно натуралистам и наблюдать, как ведут себя возбудители заболевания в дикой природе. Мы видим, где зарождается вспышка заболевания и как она распространяется. Такой уровня понимания раньше никогда не было, этот подход обещает изменить порядок исследования возникновения вспышки заболевания среди населения“.
В настоящее время данная группа применяет этот же метод для реконструкции еще одной вспышки туберкулеза в другой социальной среде. „Мы обнаружили, насколько сильно характер распространения зависит от местоположения и пришли к выводу, что выявление и изоляция людей, которые побывали в местах распространения заболевания, являются неотъемлемой частью подавления вспышек таких болезней“, — поясняет доктор Гарди. Другие группы исследователей используют эт подход, основанный на анализе генома при реконструкции возникновения вспышки, вызываемой другими микроорганизмами. „Мы надеемся создать „базу знаний о возбудителях“, в которой будет описываться специфика распространения различных инфекционных заболеваний в различных социальных и экологических ситуациях. На основе этого мы сможем выделить общие черты, которые смогут повысить эффективность методов борьбы с заболеваниями во всем мире“.