Ретровирусы или РНК-содержащие вирусы после попадания в клетку начинают синтезировать вирусный ДНК-геном на основании своей вирионной РНК. Один из самых известных нам ретровирусов – вирус иммунодефицита человека (ВИЧ). Протеазы ретровируса – энзим, разрушающий белок ретровируса. Воссоздать структуру этого белкового вещества на протяжение многих лет пытались ученые, но удалось это игрокам в компьютерную игру!

Несмотря на множество исследований, экспериментов и теоретической работы, ученым на протяжении многих лет не удавалось собрать точную модель структуры протеазы ретровирусов. И тогда они решили обратиться за помощью к коллективному разуму. «Мы хотели проверить, а вдруг интуиция многих людей сможет добиться успеха там, где провалились опыт и логика», – говорит сотрудник кафедры биохимии Вашингтонского Университета доктор Фирас Хатиб ( Firas Khatib).

Fold-it – компьютерная онлайн-игра, разработанная учеными Вашингтонского Университета в рамках программы взаимодействия игр и науки в лаборатории Бейкера. В ходе игры разные команды соревновались в 3-D моделировании реальных или аналогичных реальным молекул. Игра привлекла внимание сотен людей во всем мире.

Одной из задач было и создание структуры протеазы ретровируса. Всего за три недели игрокам удалось построить точную модель энзима. Отметим, что созданная модель оказалась настолько детальна, что ученые смогли за несколько дней воспроизвести ее экспериментально, и, к своему немалому удивлению, убедиться, что она обладает всеми свойствами искомого энзима.

«Основная цель Центра взаимодействия игр и науки – попробовать решить научные задачи, с которыми ученым и компьютерам не удалось справиться, – говорит доцент кафедры информатики и инженерии, директор центра Зоран Попович. – Решение задачи о структуре вирусного энзима – это яркий пример того, как онлайн-игра, опираясь на увлекательность 3–D моделирования и соревновательный дух, может направить интуицию человечества на решение научных задач». «Теперь у нас есть очень важный инструмент, открывающий новые возможности для разработки противоретровирусных средств, включая средства от СПИДа», – пишут авторы посвященной открытию статьи во вчерашнем выпуске журнала «Nature Structural & Molecular Biology» (Естественная, структурная и молекулярная биология).